「高価で特殊な装置を必要としない、胚や組織の高精細な立体構造構築」
埼玉医科大学 解剖学 准教授 駒崎伸二 先生
使用製品
INTAGE Realia
INTAGE Realia Professional
RealINTAGE
医用画像処理ソフトウェア「Real INTAGE」を導入頂いたユーザである、埼玉医科大学 解剖学 准教授 駒崎伸二 先生の事例をご紹介します。
我々は組織学と発生学の教育と研究に携わっており、とりわけ教育においては、組織や胚の構造をわかりやすく学生に示して説明することが大きな課題となっている。そこで、我々は、そのための有効な手段の1つとして、組織や胚の構造を詳細な3Dのイメージで示したり、3Dのアニメーションで示したりする方法を試みている。
最近は、多くの研究者や教育者の間で、胚や組織を3Dイメージとして示す方法に関心がもたれ、その方法の開発が試みられている。たとえば、最近では、(1)蛍光物質で染色した胚を樹脂に包埋して、その標本を一定の厚さで削り落としながら、表出した蛍光画像を連続的に撮影し、それをもとにボリュームレンダリング法により胚の3Dイメージを立体構築する方法(Ewaldら、Dev. Dynamics、225、369-375、2002)、(2)SPLM(Selective Plane Illumination Microscope)と呼ばれる顕微鏡で撮影した像をもとに、生きた状態の胚を3Dイメージとして立体構築する方法(Huiskenら、 Science 305、1007-1009、2004)などが考案されている。しかしながら、両者とも特殊で高価な装置を必要とするために、その方法を一般に普及させることは難しい。しかも、残念ながら、それらから得られる立体像は今回紹介する方法と比べてはるかに分解能が低いために、胚や組織の微細構造の詳細な観察には不十分である。
一方、我々が考案した方法では、高価で特殊な装置を必要とせず、誰もが胚や組織の高精細な立体構造を容易に構築することができる。その方法が、以下に紹介するサイバネットシステム社のボリュームレンダリングソフト(Realia、Realia Professional、RealINTAGE)を用いた方法である。簡単に言えば、MRIやX線CTの画像の代わりに精細な光顕用の連続切片の写真を用いて、胚や組織の高精細な立体構造をボリュームレンダリングするという方法である。
最初に、胚や組織の連続切片を撮影する。その際には、撮影する解像度が出来上がった立体構造の精細さに反映するため、必要に応じて高解像度で撮影する。その連続写真の位置をImageJと、そのプラグインソフトのStackregを用いて精確に整列させる。整列させた連続画像をボリュームレンダリングソフトに取り込んで立体構築する。
この方法がいかに優れた方法であるかということを、我々が作成した胚や組織の立体構造でご覧いただきたい。
撮影した写真の解像度を上げれば、それに応じてより微細な構造の立体構造を作成することが可能である。しかしながら、それにも限界がある。それは、顕微鏡の分解能、作製する切片の厚さ、そして、ソフトが扱えるデータの容量に限界があるからである。我々の経験では、顕微鏡の分解能の0.2μm(一般的な明視野顕微鏡)、切片の厚さの0.3μm程度(エポン切片使用の場合)、そして、ソフトが扱えるデータ容量の2GB まで(64Bit版のRealINTAGE(評価用)を使用した場合)が限界である。この限界近くまでもっていくと、走査型電子顕微鏡に匹敵(光学顕微鏡の分解能の限度を越えることは不可能ではあるが)するほどの立体像の作成も可能である。
さらに、この方法で作成した3Dモデルでは、走査型電子顕微鏡を圧倒するような別な作業も可能である。それは、コンピューターの中に構築した胚や組織の内部構造まで自在に観察できることや、ソフトの機能(抽出や削除機能)を駆使すれば、コンピューターの中で胚や組織の仮想的な微小解剖が自在に行えることである。その機能により、胚や組織内に存在する一部の構造を取り出して詳細に観察したり、邪魔な部分を削除して好みの角度から標本を観察したりすることも可能である。現在のところ、世界中で紹介されている方法で、高精細な胚や組織の立体構造をその内部まで自在に観察でき、その微細解剖まで容易にできる方法はこの方法以外にはない。
ここで示したいくつかの例の他にも、さらに多くの表現方法があり、工夫しだいでそれぞれの目的に合った胚や組織の構造、さらには、細胞の構造までも多様に示すことが可能である。
今回紹介した例のみならず、この方法には研究や教育用のためのさまざまな利用法がまだ多く考えられる。たとえば、細胞を蛍光標識した組織や胚を共焦点顕微鏡で撮影して蛍光像を立体構築した後、その標本を今回の方法で立体構築し、得られた両者の3Dイメージを融合処理することにより、標識した細胞が組織や胚のどこに存在するのかを正確に示すことが可能である。
また、教育や研究用として我々が作製した標本のデータを持ち寄って世界共通の膨大なデータベースを構築すれば、それらの標本を世界中の学生や研究者がフリーのビューアーを用いていつでも自由に机上で観察することが可能になり、生命科学の教育や研究の発展に大きく貢献するであろう。
事例をご提供いただきまして、誠にありがとうございました。